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王辰院士:病原分子诊断走向临床的进展与挑战

2018-06-22  来源:网络搜集    编辑:山脚下的但丁
导读
感染大背景:临床呼吁精准诊治王院士以《流感下的北京中年》切入感染性疾病议题。在2016年全球前十死亡原因统计中,下呼吸道感染位居感染性

王院士以《流感下的北京中年》切入感染性疾病议题。在2016年全球前十死亡原因统计中,下呼吸道感染位居感染性疾病榜首,导致全球约300万人死亡,腹泻病、结核病也占据重要位置。目前,感染性疾病的诊治面临多重威胁,从2003年SARS暴发到2016年的寨卡热,新发病原体导致的重大传染病疫情层出不穷。另一方面,临床也面临着肺炎、发热待查、脓毒血症和中枢神经系统感染的病原探查难题,其中中枢神经系统感染有40-60%不能明确病因,病原难以明确将会造成严重的医疗、经济和社会负担。

2014年英国Jim O’Neill爵士发表的《全球抗菌素耐药回顾》指出到2050年,抗菌素耐药每年会导致1000万人死亡,可累计造成100万亿美元的经济损失。王院士援引此报告并指出中国作为抗生素用量大国,当前耐药形势非常严峻。我国住院的社区获得性肺炎 (CAP) 患者存在高比例的过度抗感染治疗情况,而研究表明不充分或过度的经验性治疗均不利于患者的改善预后,因此抗感染药物的使用应该建立在正确诊断基础上,不能追求抗感染的“早”而忽略鉴别诊断必要性。


谈及临床病原体的鉴定,王院士首先回顾了涂片、培养、免疫学检测等传统的病原体检测方法,重点强调了分子诊断技术的发展历程对临床诊疗的辅助性作用和逐步走入临床的多种即时检验 (POCT) 的临床应用体系。伴随着测序技术尤其是二代测序技术的迅猛发展,分子诊断技术经历了单病原体检测、多种病原体的检测Panel到基于高通量测序的病原体检测多个发展阶段,越是先进的分子诊断技术就伴随着越高的复杂度

针对临床面临的病原体检测困境,王院士引用Nature一篇题为《Transforming clinical microbiology with bacterial genome sequencing》的综述,特别分享和探讨了新技术mNGS (基于宏基因组学的二代测序技术) 在临床病原体检测中的应用价值。mNGS是一种不需要培养,直接广泛分析临床样本中微生物组的高通量测序方法。理论上,mNGS在新病原体的发现、病原体的诊断、耐药基因分析和传染病原溯源方面具有优势,但在实际应用过程中每一个检测流程都面临挑战。

在此部分,王院士引经据典,分享了领域内多篇文献研究。2014年,《新英格兰医学期刊》发表一篇mNGS 48小时内检出钩端螺旋体,帮助临床精准诊断14岁联合免疫缺陷综合症男孩感染的案例。2018年梅奥诊所发表了一篇mNGS用于人工关节感染诊断的文章,指出与传统方法学相比,mNGS具有更高的敏感性和特异性。在另外6篇文献分享中,mNGS展现了其在脓毒血症病原体鉴定、诊断病毒性脑膜炎、腺病毒分型、新发病原体鉴定 (H10N8禽流感)、传染病暴发溯源和临床耐药监测多个方面的应用价值

从全球mNGS发展角度来看,王院士列举了美国、欧洲、澳洲的mNGS 的临床应用情况,其中荷兰的格罗宁根大学医学中心从2014年就将mNGS列为常规检测方法。

 
 
 
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